专著:
1. 《胡乐新声——丝绸之路上的音乐》（合著），人民美术出版社，2005年。
2. 《论李可染艺术》，吉林美术出版社，2007年。
3. 《世纪可染——纪念李可染诞辰100周年》，吉林美术出版社，2007年。
4. 《中亚民族与宗教》（合著），江西人民出版社，2012年。
5. 《突厥汗国与欧亚文化交流的考古学研究》，上海古籍出版社，2013年。
6. 《苍狼白鹿——梦蝶轩藏草原金器》（合著），香港中文大学，2013年。
7. 《丝绸之路的古城》，三秦出版社，2015年。
8. 《丝绸之路的宗教遗存》（合著），三秦出版社，2015年。
9. 《丝绸之路与古代东西方世界的物质文化交流》（合著），三秦出版社，2015年。
10. 《草原狼纛——古代突厥历史与文化》，商务印书馆，2015年。
11. 《中国古代历史图谱·魏晋南北朝卷》（合著），湖南人民出版社，2015年。
12. 《万里同文——新疆出土汉文书迹集萃》，浙江大学出版社，2019年。
论文:
1.《九姓回鹘可汗碑考释》，《欧亚学刊》第一辑，中华书局，1999年。
2.《斯文赫定收集品的新刊楼兰文书》，《欧亚学刊》第五辑，中华书局，2005年。
3.《突厥毗伽可汗宝藏及相关问题》，《欧亚学刊》第七辑，中华书局，2007年。
4.《中外文化交流考古的新尝试》，《北京大学学报》（哲社版），2007年第2期。
5.《突厥葬俗和祭祀有关的几个问题》，《传统中国研究辑刊》第二辑，上海人民出版社，2008年。
6.《突厥王冠考——兼论突厥祆教崇拜的有关问题》，《欧亚学刊》第八辑，中华书局，2008年。
7.《鄂尔多斯金冠源流考》，《鄂尔多斯青铜器国际学术研讨会论文集》，科学出版社，2009年。
8.《马镫起源及其在中古时期的传播新论》，《欧亚学刊》第九辑，中华书局，2010年。
9.《吐鲁番交河沟西墓地突厥因素略论》，《吐鲁番学研究——第三届吐鲁番学暨欧亚游牧民族的起源与迁徙国际学术研讨会论文集》，上海古籍出版社，2010年。
10.《突厥陵墓形制及其与唐代帝陵的互动》，《考古学集刊》第18集，科学出版社，2010年。
11.《中国考古学·秦汉卷》部分章节，中国社会科学出版社，2010年。
12.《新疆鄯善吐峪沟石窟寺遗址》，《中国文物报》2011年1月21日。
13.《新疆鄯善吐峪沟石窟寺遗址新发现》，《文化遗产》2011年5月。
14.《新疆鄯善吐峪沟石窟寺遗址》，《考古》2011年第7期。
15.《新疆鄯善吐峪沟东区北部石窟寺发掘简报》，《考古》2012年第1期。
16.《新疆鄯善吐峪沟西区北部石窟寺发掘简报》，《考古》2012年第1期。
17.《中国境内祆教相关遗存考略（之一）》，《欧亚学刊》新2辑，商务印书馆，2015年。
18.《近年吐峪沟石窟考古收获与认识述略》，《欧亚学刊》新3辑，商务印书馆，2015年。
19.《高昌故城考略》（合著），《古代文明》第9卷，科学出版社，2015年。
20.《北庭故城形制其年代略论》，《北庭学研究》第一辑，新疆人民出版社，2015年。
21.《丝路申遗要兼顾各种遗址类型》，《世界遗产》2015年5期。
22."A Study of Turkic Royal Crowns: With a Discussion of Turkic Xian-Zoroastrian Beliefs" , in Eurasian Studies V, 2017.
23.《中国境内中古祆教徒葬俗考论（之一）》，古代文明，2018年。
24.《中国考古学：三国两晋南北朝卷》部分章节，中国社会科学出版社，2018年。
25.《“汉唐丝绸之路的开拓——西域都护府研讨会”综述》，《西域研究》2018年2期。
26.《中国境内古代祆教遗存考古学研究》（之二），《欧亚学刊》第8辑，商务印书馆，2019年。
27.《3—6세기중국마구및막구를통한주변과의교류》，인제대학교 가아문화연구소，2019年。
28.《丝绸之路上的汉风景观》，载《丝路无疆——丝绸之路文化论坛新疆论文集》，浙江大学出版社，2019年。
29.《<一带一路文明史迹>总序》，陈同滨、陈凌主编《一带一路文明史迹》，中国建筑工业出版社，2021年。
30.《<一带一路文明史迹·城镇卷>总论》，陈同滨、陈凌主编《一带一路文明史迹》，中国建筑工业出版社，2021年。
31.《<一带一路文明史迹·宗教教>总论》，陈同滨、陈凌主编《一带一路文明史迹》，中国建筑工业出版社，2021年。
32.《轮台卓尔库特古城考古收获》，《西域研究》2021年2期。
33.《汉西域都护府遗址探索》，《文物天地》2021年7期。
34.《影刊日藏< 三国志>写本残卷序》，日本藏汉籍古钞本丛书第五辑之《三国志》，华东师范大学出版社，2022年。
35.《通与界的可能》，《中国史研究》2022年3期。
36.《千山共色万里同文——新疆出土汉文书迹见证的历史》，《新疆日报》2022年4月20日。
37.《西域都护府考古探索与反思——基于方法论的观察》，《中华民族共同体研究》2023年5期。
38.《探寻西域都护府的关键遗址 乌什喀特古城小记》，《中国民族》2023年5期。
39.《它为何纳入“考古中国”重大项目 卓尔库特古城小记》，《中国民族》2023年5期。
