学术论著 ：

专著：
1.《中国古玉研究文献指南》，科学出版社，2004年；
2.《中国岫岩玉》，科学出版社，2007年；

论文：
1.《有关岳石文化的几个问题》，《考古与文物》1984年1期；
2.《山东昌乐县邹家庄遗址发掘简报》，《考古》1987年5期；
3.《什么是考古学》，《文史知识》1988年1期；
4.《谈磁山文化的几个问题》，河北省文物考古学会、河北省文物研究所、邯郸市文物管理处编《磁山文化论集》，河北人民出版杜，1989年；
5.《试论中石器时代》，《北京大学学报（哲学社会科学版）》1989年4期；
6.《残破遗址及零星古墓葬发掘方法》，《文物工作》1990年3期；
7.《从磁山、裴李岗文化的命名谈到原始文化的命名问题》，《江汉考古》1990年1期；
8.《王屋山风景名胜区文物古迹的考察与研究》，谢凝高主编《王屋山风景名胜资源综合考察研究》，河南人民出版社，1993年；
9.《北方新石器文化中人骨标本的碳十四年代的初步分析》，北京大学考古系编《考古学研究（二）》，北京大学出版社，1994年；
10.《从旧石器时代向新石器时代过渡的清晰轨迹》，《南方文物》1995年1期；
11.《河南济源市王屋山地区石器时代地点调查》，《考古》1995年10期；
12.《更新世-全新世界限的划分与中国石器时代分期研究综述》，《江汉考古》1996年1期；
13.《中国新石器时代早期文化的发现、研究及相关问题的探讨》，北京大学考古系编《考古学研究（三）》，科学出版社，1997年；
14."New achievements in the study on the transitional Perioa from the palaeolithic to the Neolithic in China", Documanta Prehistorica XXV, 1998;
15.《山西吉县柿子滩遗址的年代与文化研究》，《考古》1998年6期；
16.《先秦玉器和玉文化》，袁行霈主编《中华文明之光 第一辑 秦汉魏晋南北朝》，北京大学出版社，1999年；
17.《中国从旧石器时代向新石器时代过渡阶段研究的新进展》，英德市博物馆、中山大学人类学系、广东省博物馆编《中石器文化及有关问题研讨会论文集》，广东人民出版社，1999年；
18.《新石器时代考古》，中国考古学会编《中国考古学年鉴（1998）》，文物出版社，2000年；
19.《中国早期陶器的发现、年代测定及早期制陶工艺的初步探讨》，《陶瓷学报》2000年4期；
20."The dating of Chinese early pottery and a discussion of some related problems.", Documenta Praehistorica 27,(2000):233- 240.
21.《肖家屋脊遗址出土石家河文化玉器鉴定报告》，湖北省荆州博物馆、湖北省文物考古研究所、北京大学考古学系石家河考古队编著《肖家屋脊》，文物出版社，1999年；
22.《肖家屋脊遗址石家河文化晚期玉器玉料产地初步分析》，国立台湾大学地质科学系研究报告编辑委员会《海峡两岸古玉学会议论文专辑（II）》，国立台湾大学出版委员会，2001年；
23.《中国早期陶器的发现及相关问题的讨论》，北京大学考古系编《考古学研究（五）》，科学出版社，2003年；
24."A study on an early Neolithic site in North China.", Documenta Praehistorica 30, (2003):169-173.
25."Chronology of Transition from Paleolithic to Neolithic in China.", THE REVIEW OF ARCHAEOLOGY 24, no. 2 (2003): 15-20.
26.《北京斋堂东胡林全新世早期遗址的黄土剖面》，《地质学报》2002年3期；
27.《新石器时代北京人开始用火塘》，《中国矿业报》2003年6月10日；
28.《北京东胡林新石器时代早期遗址获重要发现》，《中国文物报》2003年5月9日；
29.《新石器时代考古》，中国考古学会编《中国考古学年鉴（2003）》，文物出版社，2004年；
30."Early Polished Stone Tools in South China Evidence of the Transition from Palaeolithic to Neolithic.", Documenta Praehistorica 31, (2004): 131-13.
31.《东胡林人及其遗址的发现与研究》，西安半坡博物馆、良渚文化博物馆编《史前研究——中国博物馆学会史前遗址博物馆专业委员会第五届学术研讨会暨西安半坡遗址发掘五十周年纪念文集》，三秦出版社，2004年；
32.《中国史前玉器的发现与研究》，《韩国鲜文大学校学报》2005年1期；
33.《中国先史玉器》，《韩国鲜文大学校学报》2005年1期；
34.《辽海地区新石器时代玉器原料产地的初步探讨》，《中国玉学玉文化论丛 三编（下）》，紫禁城出版社，2005年；
35.《东胡林、转年、南庄头与于家沟——华北早期陶器的初步探讨》，中国社会科学院考古研究所编《华南及东南亚地区史前考古——纪念甑皮岩遗址发掘三十周年国际学术研讨会论文集》，文物出版社，2006年；
36.《东北地区史前玉器原料产地的初步考察及思考》，中国社会科学院考古研究所编《二十一世纪的中国考古学——纪念佟柱臣先生85华诞学术文集》，文物出版社，2006年；
37.《从玉器原料来源的考察看红山文化与大汶口文化的关系》，赤峰学院红山文化国际研究中心编《红山文化研究——2004年红山文化国际学术研讨会论文集》，文物出版社，2006年；
38.《北京市门头沟区东胡林史前遗址》，《考古》2006年7期；
39.《侯马东周祭祀遗址出土玉器材质的矿物学测试及产源分析》，《中原文物》2007年1期；
40.《东胡林人》，《文史知识》2008年6期；
41.《和田玉和“玉石之路”——中国人文资源的瑰宝》，刘国祥、于明主编《名家论玉（一）—2008绍兴“中国玉文化名家论坛”文集》，科学出版社，2008年；
42.《北京东胡林遗址的发掘及其意义》，罗覃（Thomas Lawton）编《全球化背景下考古学新前沿——解读中国古代传统》，美国AMS艺术、科学和人文基金会，2008年；
43.《东胡林遗址的发掘及其意义》，朱耀庭主编《北京文化史研究》，光明日报出版社，2008年；
44.《中国的玉器起源及相关问题》，刘国祥、于明主编《名家论玉（二）》，科学出版社，2009年；
45."Stable Isotope Dietary Analysis of the Tianyuan 1 Early Modern Human.", Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS 106, no. 27 (2009): 10971-10974.
46.《西北文物与考古资源综述》，《从遗产到资源——西部人文资源研究报告》，学苑出版社，2010年；
47.《中国玉文化的特质及其普世价值》，刘国祥、于明主编《名家论玉（三）》，科学出版社，2010年；
48.《从玉料产源考察谈玉器起源的几个问题》，厦门大学人文学院历史系考古教研室、香港中文大学中国考古艺术研究中心编《东南考古研究（第四辑）》，厦门大学出版社，2010年；
49."A Functional Analysis of Grinding Stones from an Early Holocene Site at Donghulin, North China." ，Journal of Archaeological Science 37, no. 10 (2010): 2630-2639.
50."Microwear Analysis of a Bone-Handled Microblade Excavated at Shangzhai Site in Beijing; Evidences from ESEM."，Science China. Earth Sciences 53, no. 9 (2010): 1335-1342.
51.《中国玉文化的特征及其价值》，“玉石学国际学术研讨会论文集”编委会编《玉石学国际学术研讨会论文集》，地质出版社，2011年；
52.《10000a BP前后北京斋堂东胡林人的生态环境分析》，《科学通报》2011年56期；
53.《低温陶器的烧成温度测定及其初步应用》，《南方文物》2012年1期；
54."Analysis of the Ecological Environment Around 10000 a BP in Zhaitang Area, Beijing; a Case Study of the Donghulin Site." , Chinese Science Bulletin 57, no. 4 (2012;2011;): 360-369.
55.《东胡林遗址第三次发掘再获重要成果》，《古代文明研究通讯》2015年总27期；
56.《中国玉文化的独特精神气度》，《中国社会科学报》2015年4月15日；
57.《北京平谷上宅遗址骨柄石刃刀的微痕分析:来自环境扫描电镜观察的证据》，《中国科学：地球科学》2016年40期；
58.《中国玉文化的特征及其价值》，《天工》2016年6期；
59.《世界古文明用玉习俗掇拾》，《中国社会科学报》2016年1月21日；
60.《丝绸之路上的明珠——马鬃山古玉矿遗址的发现及其意义》，中国文物学会玉器专业委员会编《丝绸之路与玉文化研究》，故宫出版社，2016年；
61."A Method of Determining Heated Ancient Nephrite Jades in China.", Scientific Reports 8, no. 1 (2018): 13523-11.
62.《北京东胡林遗址植物遗存浮选结果及分析》，《考古》2020年7期；
63.《北京东胡林遗址人骨的体质演化与生物文化适应》，《考古》2020年7期；
64."Nondestructive Analysis of Alterations of Chinese Jade Artifacts from Jinsha, Sichuan Province, China.", Scientific Reports 10, no. 1 (2020): 18476-18476.
65.《和田玉与中华玉文化》，《艺术与设计》2021年1期。