学术论著 ：

中文专著：
1. 魏正中著：《区段与组合——龟兹石窟寺院遗址的考古学探索》，上海古籍出版社，2013年；
2. 何恩之、魏正中著，王倩译：《龟兹寻幽——考古重建与视觉再现》上海古籍出版社，2017年。
英文专著：
1. Howard, A.F., G. Vignato, Archaeological and Visual Sources of Meditation in the Ancient Monasteries of Kuča. Brill, 2014；
2. Giuseppe Vignato & Satomi Hiyama, Traces of the Sarvāstivādins in the Buddhist Monasteries of Kucha . Dev Publishers & Distributors,2022.
中文论文：
1. 魏正中：《图齐：印度西藏》，《华林》2001年1期；
2. 魏正中：《克孜尔石窟前的木构建筑》，《文物》2004年10期；
3. 魏正中：《克孜尔谷西的石窟寺院》，《燕京学报》新十六期, 2004年；
4. 魏正中：《罗马建筑革命：从尼禄到哈德良》，《文汇报》2013年11月4日；
5. 魏正中：《克孜尔石窟的特殊遗迹》，新疆龟兹研究院编《龟兹石窟保护与研究国际学术研讨会论文集》，科学出版社，2015年；
6. 魏正中：《超越图像——考古学视角对龟兹佛教研究的贡献》，李四龙主编《人文宗教研究（第七辑）》，宗教文化出版社，2016 年；
7. 魏正中：《石窟寺考古的新探索——龟兹石窟调查与研究》，北京大学中国考古学研究中心、北京大学震旦古代文明研究中心编《古代文明（第11 卷）》，文物出版社，2016年；
8. 魏正中著，庄妤译：《龟兹石窟寺院中的连通建筑》，《敦煌研究》2018年2期；
9. 魏正中著，赵蓉译：《伽蓝遗痕——克孜尔石窟出土木制品与佛教仪式关系的考古学观 10. 察》，《敦煌研究》2020年1期；
11. 魏正中：《边界与山门：关于龟兹佛教寺院的若干思考》，大足石刻研究院、四川美术学院大足学研究中心编《大足学刊（第五辑）》，重庆出版社，2021年。
英文论文：
1. "Kizil: Characteristics and Development of the Groups of Caves in Western Gu Xi", Annali dell'Università degli Studi di Napoli "L'Orientale" 65 (2005): 121-140;
2. "Archaeological Survey of Kizil – its Groups of Caves, Districts, Chronology and Buddhist Schools", East and West, 56, 4 (2006): 1-58;
3. "The Wooden Architecture of the Kizil Caves", Journal of Inner Asian Art and Archaeology 1 (2006): 11-27;
4. "Towards a More Reliable Chronology for the Site of Kizil: a Discussion on Method", Kizil on the Silk Road, Crossroads of Commerce and Meeting of Minds. Rajeswari, Ghose ed., Mumbai: Marg Publications (2008): 32-39;
5. "Chinese Edition of Giuseppe Tucci’s Indo-Tibetica", East and West 58 (2008): 415-421;
6. "Inter-relationship of sites, districts, groups and individual caves in Kucha", Journal of Inner Asian Art and Archaeology 5 (2010): 129-143;
7. "Qiuci Caves: special features", In Xinjiang Kucha Academe ed., International Conference on Conservation and Research of the Kucha Caves, Kexue Chubanshe (2016): 217-227;
8. "Searching for Silence in the Ancient Monasteries of Kuča - meditating in the mountain caves." Online pubblication “Archeologia delle Vie della Seta: Immagini, Percorsi e Cultura Materiale” Università degli Studi di Napoli, L'Orientale;
9. "Qizil: an Interpretation of District Six – Caves 109-121 in Gunei", Annali di Ca‘ Foscari, Serie Orientale 52 (2016): 145-172;
10. "Kočo – rammed earth, adobe and a little timber." In Konczak-Nagel I. and L. Russell- Smith eds. The Ruins of Kočo - Traces of Wooden Architecture on the Ancient Silk Road. Museum für Asiatische Kunst, 2016, 81-88;
11. "Monastic Fingerprints – Tracing Ritual Practice in the Rock Monastery of Qizil through Archaeological Evidence." Indo-Asiatische Zeitschrift. 20/21 (2016-2017): 22-38;
12. “Historical Photographs of Kucha: Retracing Lost Caves and Related Thoughts.” Religions. 14, 7 (2023): 903;
13. “Solids and Voids in the Rock Monasteries of Kucha .” International Journal of Buddhist Thought and Culture 33, 1 (2023): 165-192.
编著及译著：
1. 图齐著，魏正中、萨尔吉主编《梵天佛地》八册，上海古籍出版社、意大利亚非研究院，2009年；
2. 魏正中、萨尔吉编译《探寻西藏的心灵——图齐及其西藏行迹》，上海古籍出版社、意大利亚非研究院，2009年；
3. 法切那、菲利真齐著，魏正中、王姝婧、王倩译《犍陀罗石刻术语分类汇编——以意大利亚非研究院巴基斯坦斯瓦特考古项目所出资料为基础》，上海古籍出版社，2014年；
4. 卡列宁、菲利真齐、奥里威利编著，魏正中、王倩编译《探寻犍陀罗艺术之源——斯瓦特地区早期佛教考古与艺术》，上海古籍出版社，2015年。